世界中を巻き込んだ大戦により、日本はそれまでの地名や地理を失い、真っさらな土地と成り果てた。 大戦から十数年が経過した新興都市・太京州。荒廃と再建の狭間で、その都市は急速に成長を遂げるも、その影に潜む暗部と裏社会の膿が膨大に膨れ上がり、都市は未だ混沌とした状態を脱していなかった。 皇嶽院（こうがくいん）――それは、法では裁けぬ特異囚人を“矯正戦闘機関”として管理し、都市内の治安を守るべく活動している特殊な組織である。囚人と看守の関係で成り立ち、その職務には過酷かつ危険な任務が数多く待ち受けている。 「社会奉仕」と称されるこの任務では、犯罪者でありながらも一定の条件で減刑される特異囚人が、外部の依頼を受けて命を懸けた作戦に従事することが許されている。